預防—阻絕境外威脅，防範境內風險
(ㄧ) 強化情資取得與分析：
1.國際方面：與歐盟及美國等重要盟邦建立聯繫管道，情資分享，掌握全球最新動態，並協調各單位加強與國際間反恐情報交流與經驗分享。 2.國內方面：協調國安單位深化情報作為，加強預警能力。相關單位接獲有關恐怖活動及重大人為危安情資時，必須彼此通報，協調整合，加速應變處置效能。
(二)強化管制及阻絕措施：
藉「國土安全政策會報」及相關協調會議，督導移民署強化邊境管制；經濟部、財政部關務署、內政部、衛生福利部等加強各種恐怖攻擊可資利用的物資管制；法務部、金管會等阻斷恐怖組織資金來源等。
(三)推動「IHR指定港埠核心能力計畫」：
配合WHO推動IHR (International Health Regulations)，召集中央相關部會並整合公、私跨部門及各港埠駐港單位共同參與，要求從港埠源頭管控生物、食品、化學、人畜共通疾病、核輻射等所有可能造成疾病國際傳播之公共衛生危害，已完成二期計畫，含括七個港埠，可涵蓋我國九成五以上之入、出國旅客數及貨物吞吐量，並已通過國際專家認證。